2005年，我国医药保健品对外贸易继续保持快速增长。据海关统计，2005年我国医药保健品进出口总额达到256.37亿美元，同比增长23.52%。
出口方面，尽管面临着人民币汇率调整、国内竞争加剧、国际市场遭遇诸多贸易壁垒与贸易争端的不利因素，通过全行业的努力，出口额依然达到138.02亿美元，同比增长28.14%，多年来首次超过全国外贸出口增长速度，比全国外贸出口增速高出5个百分点。其中，中药类出口8.3亿美元，西药类出口87.58亿美元，医疗器械类出口42.13亿美元。进口增速略有下降，进口额达到118.35亿美元，增长18.54%，增速同比下降5.5个百分点。其中，中药类进口2.4亿美元，西药类进口77.63亿美元，医疗器械类进口38.32亿美元。医药保健品出口增幅高于进口增幅9.6个百分点，顺差19.67亿美元。2005年，国际医药市场贸易总额约为2700亿美元，我出口额占国际医药市场贸易总额的5.11%，比2004年提高了0.7个百分点。2005年我国医药工业总产值约为4000亿元人民币，外贸出口贡献值已占到27.8%。
回顾2005年我国医药保健品出口有如下特点：
一、亚、欧、美仍是我出口主要市场。国际市场对我产品需求旺盛，我对主要市场的出口均衡增长。在经过了十多年的年均7%的较高增长以后，2005年，国际医药市场增长减缓，据有关统计，2005年国际医药市场增长约为5%，市场总额约为5800亿美元，欧美和日本约占市场总额的89%，国际市场尤其是周边和发达国家对我医药类产品需求仍然十分旺盛。2005年，我医药产品出口覆盖了全球六大洲214个国家与地区，其中以对周边和对发达国家为主。全年对亚洲出口57.88亿美元，占出口总额的41.93%。对欧洲出口37.74亿美元，占出口总额的27.34%。对北美洲出口27.92亿美元，占出口总额的20.23%。以上三大市场占我国出口总额的84.08%。对六大洲出口增速均超过了25%。美国、日本、印度、德国和韩国排出口前五位。在出口排位前20个国家与地区中，对印度出口增长高达47.58%，对泰国、比利时、俄罗斯、加拿大、西班牙、澳大利亚、法国、韩国、荷兰8个国家的出口增长超过了30%。对我国香港特区的出口增长最慢，出口额5.97亿美元，排出口的第六位，同比增长7.31%，表明香港在我医药产品出口中转地位进一步下降。
二、企业国际化意识进一步增强。国内产能增加，出口竞争激烈。出口经营队伍进一步扩大，一批公司逐步形成医药产品进出口的规模化经营。我国的医药产业在经过GMP强制认证以后，产业水平有了较大提高，产能进一步扩大，加上药品连续几次较大幅度降价，国内市场竞争激烈，企业国际化的意识进一步增强，更多的企业尤其是江浙沿海地区的民营企业将市场重点转向国际。2005年海关统计有医药保健品出口实绩的企业15271家。出口实绩在10万美元以上的经营性企业6184家。出口在1000万美元以上的规模性经营企业281家，出口额66.73亿美元，占出口总额的48.35%。出口在5000万美元以上的大中型出口企业24家，出口额18.25亿美元，占出口总额的13.22%。浙江省医药保健品进出口公司、东北制药总厂、欧姆龙（大连）有限公司出口突破1亿美元。浙江省医药保健品进出口公司出口达到了1.4亿美元。
三、出口仍以原料药为主。出口产品技术含量有所提高，但产品结构仍然不理想。在出口产品结构方面，仍以原料药为主，全年西药原料药出口达到79.03亿美元，同比增长27.55%，占出口总额的57.26%。出口超过1亿美元以上共有柠檬酸、VC、四环素、青霉素工业盐、VE、扑热息痛等7个单品种和14个混合品种。原料药出口产品技术含量有所提高，一批企业通过了FDA和欧盟认证，出口价格有所提高。2005年每吨售价2983美元，同比增长10.49%。中药中药材和提取物出口6.81亿美元，占中药出口的82.05%。其中提取物出口2.97亿美元，同比增长31.17%。
四、医疗器械与设备贸易逆差进一步缩小。我国的医疗器械产业尤其是大型医疗设备产业近几年有较快发展，2005年国内医疗器械总产值达到了770亿元人民币，已基本上扭转了大型医疗设备全部依靠进口的局面。在小型医疗器械与按摩器具方面，我国产品有一定的竞争优势，近几年出口的发展推动了我国医疗器械产品出口发展。2005年医疗器械与设备出口36.79亿美元，连续3年出口增速超过了30%。从2000年到2005年我国医药类产品出口增长168.52%，而医疗器械与设备的出口增长了266.43%，高出了100个百分点。贸易逆差进一步缩小，2004年我国医疗器械与设备的贸易逆差为6.2亿美元，2005年缩减到1.07亿美元。出口增长超过进口增长17个百分点。按摩器具出口6.13亿美元，比2004年增长48.72%，占医疗器械与设备出口的16.65%。高科技含量的大型和先进医疗设备出口有较大增长，核磁共振成像设备出口196台，金额达5467万美元，同比增长95.57%。彩色B超出口3278台，金额4534万美元，同比增长121.94%。B超出口13967台，金额6366万美元，同比增长89.71%。进口增速持续下降，总额38.32亿美元，同比增长15.34%，增速下降了17个百分点。进口以大型和先进医疗设备为主，彩色B超、X射线断层检查仪和核磁共振成像装置进口仍有较大幅度的增长。
五、制剂出口面临两大瓶颈。出口增长缓慢，制剂进出口逆差进一步扩大。至2005年底，我国已有5000多家企业通过了药品GMP认证，医药产业水平有了较大提高，产能迅速扩张。但我国医药研发能力较低，国际竞争力不高，国外药品注册和国外市场营销是制约我制剂产品出口的两大瓶颈。中药出口仍然难以进入医药主流市场，西药缺乏自主知识产权。同时，国外跨国公司加大了对我国医药市场的开发力度，进口大幅增长。2005年，西药制剂出口3.78亿美元，同比增长22.26%，中成药保健品出口1.53亿美元，同比增长10.27%。与2000年相比，中西成药出口由2.99亿美元增长到5.31亿美元，5年间增长了77.59%，远远低于医药保健品出口总增速。2005年，西药制剂进口15.69亿美元，同比增长23.77%，中成药保健品进口1.18亿美元，同比增长35.6%。制剂进口总额16.87亿美元，是我制剂出口的3倍，贸易逆差11.56亿美元。制剂进口增速高达24.59%，高于出口增速6个百分点。
2006年，国际医药市场对我产品需求增长，国内产业发展水平进一步提高，政策环境进一步改善，这些都给出口发展带来了较好机遇。但同时，由于人民币持续走强，原料药出口面临着反垄断与反倾销的双重挤压，制约制剂出口的根本性问题没有得到有力的改善，这些都是2006年所面临的艰巨挑战。
国际市场上，医药产品仍将保持5%以上的增速。非专利药市场进一步扩大，发达国家原料药生产继续转移，天然药物市场进一步扩大，发达国家与周边国家对我医药产品仍保持着强势需求。国际跨国公司将进一步加大对我国医药市场和医药产业的关注，通过投资并购资本重组合作研发等方式进入我国的医药产业，并进一步促进我国医药产业的国际化。我国原料药出口虽然面临着很多不利条件的挤压，但依然据有很强的竞争优势。制剂产业要加大对重点市场尤其是发展中国家市场开发的力度，利用国内已有的产能，积极争取通过国外相关认证，加大委托加工，消耗多余产能。
医疗器械与设备的出口将有广阔的发展前途，尤其是要扩大高科技水平的大型和先进医疗设备的出口。
2005年，我国外贸进出口总额达到了1.4万亿美元，我国已成为第三大贸易国和第二大出口国。但我国出口产品结构不理想，资源与环境成本过高。大力发展我国生物医药产品的出口是落实科学发展观，实现我国外贸出口增长方式的根本性转变的重大举措。2005年，商务部等8部委联合出台了《关于扩大我国医药产品出口的若干意见》，商务部在全国认定了15个国家医药出口基地，国家与地方政府都将陆续出台一些相关的支持政策。将给发展医药产品出口带来较为有利的发展环境。同时，我国医药产业和医药出口行业近年有很大的发展，研发能力进一步增强，通过国际认证的企业数量进一步增加。作为市场经济主体的企业国际化意识进一步增强，很多企业已在多年的努力中摸索出进入国际市场的成功经验。国内的中介服务也在迅速成长，中国医药保健品进出口商会将在2006年进一步加强对行业的信息、展览、国外注册等服务和行业协调、贸易救济等措施，进一步推动品牌战略的走出去战略的实施，促进产业的国际化。从政府、企业和中介服务三个层面上，都为扩大2006年我国医药产品出口创造了较为有利的条件。同时，由于国内市场需求的增长和跨国公司的努力，我国2006年医药产品进口仍将有较大的增长。我国医药产业的国际化程度将有进一步的提高。2006年，我国医药产品的出口增速将保持在20%以上，进口将保持在15%以上。